Une chapelle dédiée à saint Jean-Baptiste a été construite, à l'emplacement de l'église actuelle, non loin des bords de Seine, vers 1540. Deux siècles plus tard, du fait de l'accroissement de la population, elle est détruite et remplacée par une église, ouverte au culte en 1779. En 1790, elle accueille la réunion du premier Conseil municipal. Jugée une nouvelle fois trop petite, elle est démolie en 1827. L'architecte Jacques Molinos et son fils sont aussitôt chargés d'édifier un nouveau bâtiment. De style néo-classique, il sera achevé en 1831. La guerre de 1870, puis la Commune vont l'endommager gravement. De 1911 à 1918, l'église est rénovée ; une chapelle annexe et un presbytère l'agrandissent.
L'église Saint-Jean-Baptiste est située sur l'artère extrêmement animée qu'est l'avenue Charles de Gaule à Neuilly-sur-Seine. Elle possède quelques très belles toiles des XVIIe et XVIIIe siècles (dont «La Crucifixion» du chœur), classées au titre des Monuments Historiques. Son maître-autel est enrichi d'éléments de la fin du XVIIe et venant d'un ancien retable. Enfin, les fonts baptismaux, qui remontent au XVe siècle, proviennent de l'église Saint-Martin de Villiers-la-Garenne dans les Hauts-de-Seine.